徹社は、天照大神和魂を祀り、
本宮後方にあるらしい一之御前神社は、天照大神荒魂を祀る。

また、境内には楠の巨木が多いが、
社殿を持たず垣の中に、楠の神木を祀った楠御前社がある。
手水舎の側には、弘法大師手植の「七本楠」の一つ、大楠がある。

宝物殿の北には、六つの祠が並んだ六末社。
南から、日長神社（日長命）、素盞嗚神社（素盞嗚尊）、
水向神社（弟橘媛命）、今彦神社（建稻種命）、
姉子神社（宮簀媛命）、乙子神社（弟彦連）と並んでいる。

六末社の北には大幸田神社（宇迦之御魂神）。
境内西門の脇には、菅原社（菅原道眞）。
信長塀の側には参道を挟んで東西の八百萬神社が鎮座。

本宮の東側に、土用殿がある。
明治になるまで神剣・草薙剣が奉安されていた社殿で、
戦争で焼失したが、昭和四六年に再建された。

本宮の東側奥に清水の湧き出す場所があり、
清水社（罔象女神）が祀られている。
清水社の南には、式内社である御田神社（大年神）。
社伝では天武天皇朱鳥元年の創祀。
さらに南には、龍神社（吉備武彦命・大伴武日命）。
日本武尊の東征に、建稻種命とともに従った神々を祀る。