長野県安曇野市（旧穂高町）にある。
穂高駅の東すぐの場所に、東向きに鎮座。

境内の北側に大駐車場があり、大きな鳥居が立っている。
表参道は東側。
参道の鳥居をくぐると、かなり広い境内。
左手に社務所があり、直進すると、もう一つの鳥居。

境内中央に神楽殿が立ち、右手には若宮社を中心とした末社群。
神楽殿の後方に左右に長い拝殿。
拝殿の奥、垣に囲まれて三棟の本殿が並んで立っている。
三棟の大きさは、ほぼ同じだが、中央の社殿のみ「穂高造」とよばれる様式。
「穂高造」は、基本は流造だが、屋根の勝男木が特徴的。
一般の勝男木は、屋根の嶺に直角に並んでいるが、
「穂高造」では、二本の勝男木が中央から左右の千木に斜めに立てかけられている。
一説には、釣り竿や船の櫓を水辺で立てかけた形。
海神を祀る神社には相応しい様式。

創祀年代は不詳。

社伝によると、神代の昔、
人跡未踏の穂高岳に、祭神・穗高見神が降臨し、
重畳なる中部山岳を開発。
さらに梓川流域の安曇筑摩地方を開拓したという。

当地の豪族、安曇氏が祖神を祀った神社であり、
上下の崇敬を集めた古社。

本殿の三棟に祀られている神々は、
中央穂高造に穗高見神、右に綿津見神、左に瓊々杵尊。

穂高神社は、当地の本宮と、上高地明神池にある奥宮、
さらに、奥穂高岳山頂にある嶺宮の三社だが、
祭祀の中心は、当社・本宮。

本殿三棟の右手には、別宮・神明社（天照大御神）。

若宮社を中心とする末社群は以下の通り。向って左から、
八坂社（素盞嗚尊）、事比羅社（大物主神）、
子安社（木花開耶比売命）、保食社（宇気母智命）、
四神社（少名彦名命 八意思兼命 誉田別尊 蛭子神 猿田比古命）。
中心に、摂社・若宮社（阿曇比羅夫、信濃中将）。
さらに、疫神社（素盞嗚尊）、秋葉社（軻遇突智命）、
八幡社（誉田別尊）、鹿島社（武甕槌命）。

若宮社に祀られている阿曇比羅夫は、
祭神・穗高見神の後裔であり、安曇氏中興の偉人。

若宮社の相殿に祀られている信濃中将は、
ものぐさ太郎として有名な人物。
ものぐさだった若者（実は仁明天皇の孫だったという）が
文徳天皇の御宇、甲斐・信濃の国司として国を治め
穂高神社を造営したという。

境内の北側、駐車場のそばには、菅原社を中心とした末社。
八王子社（五男三女神）、菅原社（菅原道真公）歌神社（柿本人麻呂公）。

穂高神社本宮由緒 安曇族の祖神穂高見命は、海神綿津見神の御子神で、 太古穂高岳に天降りましたと伝えられている。安曇族は 海神系の宗族として遠く北九州に栄え、信濃の開発に功を 樹て、安曇野の中心穂高の里に祖神を奉斎したのが、当 神社の創始である。 一、 御祭神 中　殿（中　央） 左　殿（向って右） 右　殿（向って左） 別　宮 穂高見命（神武天皇の叔父神） 綿津見神 瓊々杵尊 天照大御神 一、 主祭典 奉　射　祭 例　祭　宵祭 （御船祭）本祭 式年遷宮祭 三月　十七日 九月二十六日 九月二十七日 （大）平成二十一年（中）平成二十八年（小）平成三十四年 一、 本殿建築様式 穂高造（一間社流造の変形で、勝男木・脇障子に特徴を見る） 一、 社　格 延喜式（九二七年選進）神名帳所載の式内名神大社 旧国幣小社、現神社本庁別表神社 一、 御神徳 海の幸と山の幸を兼備した御神徳は広大無辺、特に殖産興業、海陸交通安全の守護神として名高い。 ○ ○ 奥宮 嶺宮 上高地明神池畔に鎮座 奥穂高岳頂上に鎮座 −境内案内板− 阿曇比羅夫之像 解説 　大将軍大錦中阿曇連比羅夫は、 天智元年（６６２年）天智天皇の命を受け、船師 １７０艘を率いて百済の王子豊璋を百済に護送、 救援し王位に即かす。天智２年、新羅・唐の 連合軍と戦うも白村江（朝鮮半島の錦江）で破 れ、８月申戌２７日戦死する。 ９月２７日の例祭（御船祭）の起因であり、 阿曇氏の英雄として若宮社に祀られ、英智の 神と称えられている。 伝統芸術である穂高人形飾物は、阿曇比羅夫 と一族の勇姿を形どったものに始まると伝え られる。 境内石碑より