滋賀県大津市にある。
京阪石山坂本線・錦駅の北３００ｍほど、
ＪＲ東海道線・膳所駅の東５００ｍほど、
琵琶湖大橋西詰の北西５００ｍほどの西の庄に鎮座。
琵琶湖の南側、相模川の河口部、小学校の近くに境内がある。

境内入口は、道路に面して北向き。
鳥居の右手には「式内石坐神社」と刻まれた社号標が立ち、
左手の石碑には時計が埋め込まれている。
鳥居扁額に「石坐神社」。

鳥居をくぐると広い砂利の境内。
左手（東側）に拝殿があり、
拝殿の後方、垣に囲まれた本殿がある。
三間社流造の本殿は、鎌倉時代文永三年（１２６６）の建造で、
昭和三十二年県の有形文化財に指定されたもの。

下記の由緒にあるように、創祀の頃は茶臼山後方、
相模川の上流にある御霊殿山に鎮座していたという。
御霊殿山はこのあたり　→　
山頂には巨大な磐座があるらしく、山頂の山宮に対して里宮と考えられている。

また、茶臼山古墳と小茶臼山古墳は、
当社祭神大友皇子と彦坐王命の陵墓であるという。

創祀年代は不詳。
社伝によると、瀬田に設けられた近江国府の初代国造・治田連が
その四代前の租・彦坐王命を茶臼山に葬り、
その背後の御霊殿山を神体山（神奈備）として祀ったのが創祀。

天智天皇八年に旱魃があり、
その時、毎夜琵琶湖湖水から御霊殿山に竜燈が飛んで行った。
里人の奉聞により派遣された勅使の前で、竜燈は小童に姿を変え
「われは海津見神の幸魂である。旱害を除いてやろう」
との託宣があり、勅令により御霊殿山に海津見神を祀ったという。

この幸魂は彦坐王命の霊であると言われ、
毎年、九月九日に祭典を行い、旱天の時は炬火を点じて登山し
雨乞いを行うと、かならず霊験があったという。

壬申の乱の後、近江朝の神霊である天智天皇、大友皇子、皇子の母宅子媛を弔祭できるのは
一乗院滋賀寺のみとされ、他で祭祀することが禁じられていた。
そこで、持統天皇の朱鳥元年に滋賀寺の僧・尊良法師が王林に神殿を建て、
御霊殿山の霊祠を遷すとともに相殿に、密かに祀り、
この時から八大龍王宮とも石坐神社とも称したという。
王林は、今の錦駅付近で、昔は石坐野、後に石神町と呼ばれた地域。

光仁天皇の宝亀四年、石坐神社に正一位勲一等が授けられ、
「鎮護国家の神社なり」との勅語を賜り、
近江朝の三神霊が、公式に石坐神社祭神と認められたという。

よって、当社は彦坐王命（海津見神）を祀る八大龍王宮と
近江朝の三神霊（天智天皇、大友皇子、伊賀宅子媛命）を祀る正霊天王宮を合わせたもの。

鎌倉時代の文永三年（１２６６）、現在地に粟津八宮の一つとして遷座再建。
一説には、佐々木（六角）高綱は源義仲追討の際、
宇治川の先陣をつとめたあと、当地に勧請したとも。

明治になって高木神社と改称し、大正六年旧石坐神社に戻したという。
高木神社と呼んだのは、高い木の下にあったからだという。

境内の右手に石が祀られていたが、社名「石坐」と関連があるのだろうか。
また、石神社（彦坐王命）が祀られており、新しい石の坐像がある。
境内奥には、弁財天と稲荷社。
境内西側の社務所の横には、淡海石坐大神・天上将来宮と書かれた
全国神社遥拝所がある。

社殿や提灯には三つ巴紋が付けられていた。
たぶん、当社の神紋だろう。